С 1918 по 1991 в зданиях закрытого Богородице-Рождественского монастыря размещались отделы ВЧК-ОГПУ-НКВД-КГБ и следственный изолятор. Имеются данные, что здесь приводили в исполнение расстрельные приговоры и захоранивали тела расстрелянных. Место захоронения установлено органами государственной безопасности по Владимирской области в ходе работы по пересмотру уголовных дел на лиц, незаконно репрессированных в 1930-е – нач.1950-х.

Постановлением Главы администрации Владимирской области (№5 от 04.01.1992) место захоронения жертв политических репрессий на территории бывшего Рождественского монастыря признано мемориальным кладбищем. Осенью 1992 территория монастыря была передана в распоряжение Владимиро-Суздальской епархии. 30 октября 1993 в память казненных в арочной нише монастырской ограды был открыт и освящен поклонный крест. Памятный знак создан по инициативе депутатов Владимирского городского совета народных депутатов на средства из городского бюджета. В основании креста надпись: «Бог да упокоит души безвинно убиенных в земле Владимирской». Справа от креста на стене помещен список из 28 человек, расстрелянных на территории монастыря (приговорены осенью 1930 по делу по сфабрикованному ОГПУ групповому делу). Тогда же, в 1993, на внешней стене монастыря была установлена мемориальная плита с текстом: «На территории монастырского сада были тайно захоронены безвинно казненные в годы репрессий». В 2005 крест был перенесен к Рождественскому собору. В 2010 поклонный крест включен в реестр охраняемых объектов культурного наследия как выявленный памятник истории.

Ежегодно 30 октября у креста проходят городские мероприятия, посвященные памяти жертв политических репрессий, в соборе служат панихиду.