Кладбище в поселке Варнек было организовано в 1930 как кладбище заключенных и вольнонаемых Вайгачской экспедиции ОГПУ. Расположено на берегу бухты Варнека на небольшой гряде около поселка. Умерших хоронили в гробах, на могилах устанавливали надгробия. Полного списка похороненных здесь заключенных и вольнонаемных не существует, составлен поименный список на 36 человек. На территории кладбища сохранился бетонный памятник на братской могиле 24-х заключенных, замерзших осенью 1932 во льдах бухты при погрузке цинковой руды на пароход «Глеб Бокий». Здесь же в июне 1934 захоронены четверо заключенных, расстрелянных по приговору Коллегии ОГПУ. После закрытия лагеря кладбище использовалось для захоронений жителей поселка.